Senior Scientist, Bioinformatics Engineer

Specjalistka / Specjalista ds. bioinformatyki i inżynierii danych (Bioinformatics Engineer)

AstraZeneca · Warszawa, hybrydowo

Opis stanowiska

Zakres obowiązków

  • Projektowanie, implementacja i utrzymanie powtarzalnych pipeline’ów do przetwarzania, analizy i wizualizacji danych proteomowych o wysokim przepływie.
  • Tworzenie przenośnych i wersjonowanych pracowni obliczeniowych (Nextflow, Snakemake) oraz konteneryzacja środowisk (Docker) dla pracy w chmurze i HPC.
  • Budowa systemów kontroli jakości, walidacji i śledzenia danych w celu zapewnienia powtarzalnych wyników.
  • Zapewnienie zgodności z najlepszymi praktykami inżynierii oprogramowania (Git, CI/CD, dokumentacja).
  • Projektowanie modeli danych i strategii przechowywania dla danych proteomowych, uwzględniając zasady FAIR.
  • Współpraca z zespołami chemicznymi i proteomicznymi w celu integracji danych i tworzenia narzędzi wspierających analizy AI/ML.

Wymagania

  • Stopień doktorski (lub magisterski z 3 latami doświadczenia) z bioinformatyki, biologii obliczeniowej lub pokrewnej dziedziny.
  • Doświadczenie w analizie danych proteomowych, praca z chmurą (AWS/Azure) i narzędziami do automatyzacji (Nextflow, Snakemake).
  • Znajomość języków programowania R/Python oraz praktyk wersjonowania (Git).
  • Umiejętność pracy w zespole interdyscyplinarnym i komunikacji z naukowcami.

Oferta

  • Praca w modelu hybrydowym (3 dni w biurze w Warszawie, 2 zdalnie).
  • Wynagrodzenie zgodne z doświadczeniem i rynkiem.
  • Współpraca z zespołem naukowców i inżynierów danych w międzynarodowej firmie farmaceutycznej.

Podobne oferty